Το μακρινό 2000 πέντε φοιτητές (Κεσόπουλος Αλέξης, Παλάνγκας Νίκος, Δημητρόπουλος Θύμιος, Τσάκαλος Γιάννης και Ποδιάς Κώστας) αποφάσισαν να δημιουργήσουν αλλά και να κατεβάσουν την ομάδα μπάσκετ του Πανεπιστήμιου Αιγαίου στο τοπικό πρωτάθλημα της Χίου (ΤΕ ΕΟΚ Χίου). Μαζί με τη βοήθεια του μέχρι και τώρα καθηγητή Φυσικής Αγωγής της Σχολής Επιστημών της Διοίκησης, κ. Βασίλη Τσαρδάκα, τα κατάφεραν και η ομάδα μπάσκετ αποτελεί τη μόνη (μπορεί και πρώτη) αναγνωρισμένη από την Ελληνική Ομοσπονδία Καλαθοσφαίρισης Πανεπιστημιακή ομάδα. Σε αυτή την προσπάθεια μπορούσαν να συμμετάσχουν όσοι φοιτούν στο Πανεπιστήμιο Αιγαίου με έδρα την Χίο.

Από την έναρξη της -όπως είναι φυσικό- όσοι απαρτίζουν την ομάδα έχουν «απαλλαγή» από τα αναπτυξιακά τμήματα και δεν έχουν τους μηδενισμούς στα πρωταθλήματα που συμμετέχουν, καθώς όλα αυτά τα χρόνια υπάρχει άριστη συνεργασία με την Τοπική Επιτροπή.

Την πρώτη χρονιά (2000) η ομάδα αγωνίστηκε στη Β’ Ανδρών. Κατάφερε και κατέκτησε το πρωτάθλημα ενώ είχε βρεθεί μέχρι 2005 στην Α’ Ανδρών που αναρριχήθηκε στην πιο υψηλή θέση (3η) που έχει πάρει μέχρι σήμερα. Το 2005 έπεσε κατηγορία αλλά κατάφερε την περίοδο 2006-2007 να κατακτήσει ξανά το πρωτάθλημα στη Β’ Ανδρών. Ωστόσο το 2011 σταμάτησε η λειτουργία του τμήματος λόγω της αποφοίτησης των παιδιών που διαχειριζόταν την ομάδα.

Το διάστημα αυτό, από το 2000 έως το 2011, η ομάδα έπαιρνε μέρος σε πολιτιστικές εκδηλώσεις των Πανεπιστημίων που πραγματοποιούνταν στα νησιά του Βορείου και Νοτίου Αιγαίου, και κατάφερνε να είναι πάντα στις πρώτες θέσεις. Το 2002 συμμετείχε και στην Πανεπιστημιάδα όπου αντίπαλος ήταν το ΤΕΙ Πειραιά που διέθετε παίκτες όπως ο Ανδρέας Γλυνιαδάκης και ο Μανώλης Παπαμακάριος. Παράλληλα συμμετέχει ενεργά και διοργανώνει φιλανθρωπικούς αγώνες 3Χ3 μέχρι και σήμερα.

Το 2016 με τον Νίκο Γιαρμίδη να ξαναστήνει την ομάδα και τη δεύτερη χρονιά (2017-2018) να κατακτούν το πρωτάθλημα στη Β’ Ανδρών (τρίτος τίτλος για το Πανεπιστήμιο Αιγαίου), άντεξε μέχρι το 2020, όταν λόγω του covid-19 οι φοιτητές δεν ήρθαν στη Χίο και ήταν επόμενο να μην βρεθούν αθλητές για συμμετοχή.

Από το περσινό καλοκαίρι έγινε επανέναρξη του τμήματος με τον Μανώλη Παντελιό και η ομάδα πήρε μέρος στο πρωτάθλημα της ΤΕ ΕΟΚ Χίου στην Α’ Ανδρών. Συνολικά έβγαλαν δελτίο 20 αθλητές που συμμετείχαν στους 18 αγώνες χωρίς να κατακτήσουν κάποια νίκη, αλλά «γέμισαν» με εμπειρίες που θα τους βοηθήσουν στη νέα αγωνιστική σεζόν.

Για τη φετινή περίοδο(2025-2026) δήλωσαν κανονικά συμμετοχή στο πρωτάθλημα της Α’ Ανδρών (ΤΕ ΕΟΚ Χίου) όπου παίρνουν μέρος εννέα σύλλογοι και την 1^η αγωνιστική ήρθε το θετικό αποτέλεσμα για το Πανεπιστήμιο καθώς επικράτησε με 69-55 του Έφηβου.

Οδυσσέας Μακρίδης

Το Πανεπιστήμιο στα πρωταθλήματα της ΤΕ ΕΟΚ Χίου

2000-2001 Β’ Ανδρών (1^η θέση)

2001-2002 Α’ Ανδρών

2002-2003 Α’ Ανδρών

2003-2004 Α’ Ανδρών

2004-2005 Α’ Ανδρών

2005-2006 Β’ Ανδρών

2006-2007 Β’ Ανδρών (1^η θέση)

2007-2008 Α΄ Ανδρών

2008-2009 Α΄ Ανδρών

2009-2010 Α’ Ανδρών

2010-2011 Β’ Ανδρών

2016-2017 Β’ Ανδρών

2017-2018 Β’ Ανδρών (1^η θέση)

2018-2019 Α’ Ανδρών

2019-2021 Β’ Ανδρών

2024-2025 Α’ Ανδρών

2025-2026 Α’ Ανδρών